宁夏医科大学前身是1958年建立的宁夏医学院。1962年改称宁夏大学医学系。1972年，上海铁道医学院搬迁至银川，与宁夏大学医学系合并重建宁夏医学院。2002年，宁夏卫生学校、宁夏护士学校并入宁夏医学院。2008年8月，学校更名为宁夏医科大学。2014年，宁夏师范学院医学院并入宁夏医科大学，至此，学校成为宁夏唯一的医学高等教育学府。

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学校是国家教育部、卫健委、宁夏回族自治区共建高校。有教职员工及医护人员5600余人，有医学、理学和管理学3个学科门类，22个本科专业，学校有3个一级学科博士学位授予点，1个博士专业学位授予点，9个一级学科硕士学位授予点，6个专业硕士学位授予点。